Como pionero en química computacional y simulación molecular, sus contribuciones han avanzado significativamente en el campo, inspirando a innumerables investigadores.

Martin Karplus, el estimado químico teórico y premio Nobel, falleció el 28 de diciembre de 2024 a la edad de 94 años. El profesor Karplus fue reconocido por su trabajo pionero en el desarrollo de modelos computacionales para estudiar las interacciones biomoleculares. Desempeñó un papel clave en el desarrollo de CHARMM (Chemistry at HARvard Macromolecular Mechanics), que se ha convertido en una herramienta fundamental en química computacional y biofísica, avanzando en nuestra comprensión de los procesos biológicos a nivel molecular y ayudando a diseñar nuevas terapias. El trabajo del profesor Karplus, incluido su papel en el desarrollo de CHARMM, le valió el Premio Nobel de…

Entendiendo el efecto hidrofóbico


Aunque parezca bastante abstracto, las interacciones de moléculas y átomos a nivel microscópico a menudo tienen efectos profundos en las propiedades macroscópicas de los materiales y la vida misma.

El software de química de solvatación de BIOVIA proporciona el enlace científico para comprender estas conexiones entre las interacciones microscópicas y moleculares y las propiedades experimentales relevantes para la industria de los líquidos, como las solubilidades, las presiones de vapor, los coeficientes de partición y muchas más. De manera ejemplar, en esta entrada del blog, queremos discutir el efecto hidrofóbico anómalo del agua a nivel molecular y sus implicaciones en las aplicaciones industriales y la vida en la Tierra en general.

El fenómeno conocido como efecto hidrofóbico, originario de las palabras…
Materials Studio ofrece una plataforma fácil de usar pero potente para modelar una amplia gama de sistemas, y este informe se centra específicamente en polímeros y redes de polímeros. Junto con Pipeline Pilot, hay varios métodos disponibles para modelar materiales tan complejos que van desde el polietileno reticulado (XLPE) ampliamente reportado, hasta redes personalizadas con mecanismos de reacción únicos. Los campos de fuerza atómicos unidos se desarrollan para modelar de manera eficiente tales sistemas que involucran grandes cantidades de partículas, proporcionando un equilibrio entre la eficiencia computacional y la precisión.

La importancia de los campos de fuerza en la simulación molecular


Los campos de fuerza son fundamentales en la simulación molecular, ya que determinan cómo interactúan las partículas a través de enlaces y otras…
La pregunta de qué debemos hacer a continuación ha desafiado al mundo del descubrimiento de fármacos durante décadas. Durante años, los métodos computacionales para el diseño de fármacos de moléculas pequeñas han ofrecido numerosos algoritmos y metodologías para ayudar a generar nuevas ideas y guiar el proceso iterativo de diseño y optimización de leads. Para un objetivo farmacológico en particular, estos métodos ayudan a identificar candidatos de alta calidad que eventualmente pueden avanzar al desarrollo clínico con menos experimentos y tiempo en el laboratorio. Desde los primeros días de la química combinatoria y el reemplazo bioisostérico hasta el diseño basado en ligandos, fragmentos y estructuras, ha habido muchas herramientas que aprovechan numerosos algoritmos que se adaptan a las limitaciones y criterios de diseño de su proyecto. …